Akademi City adalah tempat yang sangat maju dalam hal teknologi. Hal ini mengatakan teknologinya 20 sampai 30 tahun lebih cepat dari seluruh dunia. 80% dari 2,3 juta penduduknya adalah mahasiswa. Fokus studi di sini diarahkan kekuatan super. Misaka Mikoto, salah satu pengguna kekuatan super tingkat atas di kota, berbagi kamar dengan Kuroko Shirai, lain esper tingkat tinggi yang merupakan anggota Judgement, sebuah lembaga penegak hukum yang terdiri dari siswa. Keduanya hadir untuk Tokiwadai, sebuah sekolah swasta dicadangkan untuk tinggi diratakan dan orang kaya. Mitra Kuroko di Judgement, Kazari Uiharu, adalah esper tingkat rendah yang belajar di sekolah menengah Sakugawa. Sahabat dan teman sekelas nya Ruiko Saten, sebuah tingkat nol (tidak ada kekuatan esper). Bersama-sama, petualangan empat pertemuan beberapa di kota ilmiah menarik.